Kami Salah Tentang DNA ‘Sampah’

15

Genomnya berbohong kepada kita.

Atau setidaknya. Itu menyembunyikan sesuatu.

Sebuah tim peneliti internasional baru saja mengupas lapisan biologi yang bahkan tidak kita ketahui keberadaannya. Lebih dari 1.700 yang disebut protein “gelap”. Mereka ada di sana selama ini. Tersembunyi di bagian DNA kita, kita anggap sebagai kebisingan yang tidak berguna.

Ini bukan protein biasa.

Ukurannya lebih kecil. Aneh. Ambigu.

“Kami telah memberi nama pada sesuatu yang kami lihat berpotensi untuk diteliti,” kata Sebastiaan van Heesch. Seorang ahli onkologi pediatrik dari Princess Máxima Center. “Didefinisikan secara formal. Dapat diakses.”

Selama beberapa dekade. Kami mengira hanya sebagian kecil DNA manusia yang benar-benar berfungsi. Sisanya? ‘Sampah.’ Berat mati. Kesalahan ketik kosmik.

Kami salah.

Ternyata lanskap yang diabaikan itu tidaklah kosong. Itu dikemas dengan sakelar. Kontrol. Pengungkit yang menarik gen ‘asli’. genom gelap.

Sekarang kita tahu bahwa hal ini tidak hanya sekedar mengubah keadaan. Itu juga membangun sesuatu. proteom gelap.

“Ikhtisar yang ada saat ini tidak menggambarkan gambaran yang sebenarnya,” van Heesch mengakui. “Ribuan adegan terlewatkan. Terabaikan. Tepat di depan mata kita.”

Mereka menyebut molekul baru itu peptidain.

Setengah protein. Setengah peptida. Sebuah kategori tersendiri.


Bagaimana Cara Menemukan Yang Tak Terlihat?

Anda harus berusaha sangat keras.

Tim memulai dengan 7.264 tersangka. Wilayah yang disebut bingkai bacaan terbuka non-kanonik (ncORFs). Mereka diketahui berpotensi mengkode protein. Tapi tidak ada yang tahu apakah mereka benar-benar menghasilkan sesuatu yang dapat dideteksi.

Jadi para peneliti menghitung angkanya.

3,7 miliar titik data.
95.522 percobaan.
20.000 jam. Kekuatan komputasi.

Butuh waktu lama.

“Sungguh istimewa ketika kami menyadarinya,” kenang van Heesch. “Ini sebenarnya baru.”

Dari 7.000 kandidat itu? Mereka menemukan 1.785 mikroprotein sebenarnya.


Mengapa Ini Penting?

Inilah hal tentang sains. Discovery biasanya hanya sebuah trailer. Film utamanya bahkan belum dimulai.

John Prensner. Ahli neuro-onkologi anak di Universitas Michigan. Dia melihat pengubah permainan.

“Kami sedang memasuki fase yang menarik,” katanya.

Tapi kegembiraan butuh bukti.

Awal tahun ini, tim menyempurnakan definisi mereka. Mereka memilih ‘peptidain’. Dan mereka menemukan satu kandidat tertentu yang benar-benar berhasil.

Itu berasal dari OLMALINC.

Sebelumnya dianggap sebagai gen yang tidak mengkode. Pada dasarnya, DNA diam. Tapi peptidain ini? Ini membantu kanker bertahan hidup.

Mereka menonaktifkannya di laboratorium. Sel-sel kanker berjuang untuk tumbuh.

Jadi itu berhasil.

Jika Anda bisa mematikan protein, Anda menghentikan tumornya.


Belum Ada Obatnya. Tapi sebuah Pintu.

Ini bukanlah obat kanker dalam botol.

Belum.

Kita baru berada pada tahap membaca peta. Namun potensinya sangat cemerlang. Jika molekul kecil ini mendorong penyakit. Kita mungkin memiliki target pengobatan baru. Masalah kardiovaskular. Alzheimer. Hal-hal yang telah kami jalani selama bertahun-tahun.

“Ratusan peptidain,” catat Hübner. “Visibilitas. Proteom yang diperluas.”

DNA kami tidak pernah malas.

Itu hanya sibuk.