Náš genom nás klamal.
Nebo alespoň skryl důležité informace.
Mezinárodní tým výzkumníků právě odkryl vrstvu biologie, o které jsme nikdy nevěděli. Hovoříme o více než 1700 takzvaných „tmavých“ proteinech. Byli tam celou dobu, ukryti v těch částech naší DNA, které jsme odepsali jako zbytečný hluk.
Toto nejsou vaše typické proteiny.
Jsou menší. Cizinec. Jejich povaha je nejednoznačná.
„Pojmenovali jsme něco, o čem jsme viděli, že má potenciál pro výzkum,“ říká Sebastian van Hees, dětský onkolog z Princess Maxima Centre. “Formalizovali jsme definici a zpřístupnili tato data.”
Po celá desetiletí jsme věřili, že jen malá část lidské DNA dělá skutečnou práci. A co zbytek? “Odpadky”. Mrtvá váha. Překlep ve vesmíru.
Ale mýlili jsme se.
Ukazuje se, že tato ignorovaná krajina není prázdná. Je plná spínačů, knoflíků a páček, které ovlivňují „skutečné“ geny. Toto je temný genom.
Nyní víme, že nejen koriguje procesy, ale také vytváří nové struktury. Tvoří tmavý proteom.
“Aktuální shrnutí neukazuje úplný obrázek,” připouští van Hees. “Tisíce sekvencí byly vynechány, přehlédnuty, doslova pod nosem.”
Nazvali nové molekuly peptiiny.
Poloviční bílkoviny. Semipeptid. Samostatná kategorie.
Jak najít neviditelné?
Musíte se dívat velmi pečlivě.
Tým začal se 7 264 podezřelými místy. Jedná se o oblasti nazývané nekanonické otevřené čtecí rámce (ncORF). Bylo známo, že potenciálně kódují proteiny, ale nikdo nevěděl, zda produkují něco skutečně detekovatelného.
Výzkumníci zpracovali hory dat.
3,7 miliardy datových bodů.
95 522 experimentů.
20 000 hodin. Výpočetní výkon.
Proces trval neuvěřitelně dlouho.
„Nastal zvláštní okamžik, kdy jsme si to uvědomili,“ vzpomíná van Hees. “Že je to skutečně nový objev.”
Ze 7 000 kandidátů našli 1 785 skutečných mikroproteinů.
Proč je to důležité?
To je podstata vědy. Vernisáž je většinou jen upoutávka. Hlavní akce ještě ani nezačala.
John Prensner, dětský neuroonkolog z University of Michigan, to vidí jako zásadní změnu.
“Vstupujeme do vzrušující fáze,” říká.
Ale nadšení vyžaduje důkaz.
Začátkem tohoto roku tým upřesnil své definice. Usadili se na termínu peptiin a našli jednu konkrétní kandidátní molekulu, která skutečně vykonávala funkci.
Pochází z genu OLMALINC.
Dříve se předpokládalo, že jde o nekódující gen. V podstatě „tichá“ DNA. Ale tento peptiin pomáhá rakovině přežít.
V laboratorních podmínkách jej výzkumníci deaktivovali. Rakovinové buňky měly potíže s dalším růstem.
To znamená, že mechanismus funguje.
Pokud dokážete vypnout tento protein, zastavíte nádor.
Zatím neexistuje žádný lék. Ale dveře jsou otevřené.
To není žádný zázračný lék na rakovinu v lahvičce.
Zatím.
Sotva jsme ve fázi čtení mapy. Ale potenciál je oslnivý. Pokud tyto malé molekuly řídí onemocnění, můžeme mít nové cíle pro léčbu. Kardiovaskulární problémy, Alzheimerova choroba jsou oblasti, kde jsme uvízli po léta.
“Stovky peptiinů,” poznamenává Huebner. “Nová viditelnost. Expanded Proteome”.
Naše DNA nikdy nelenila.
Byla jen zaneprázdněná.
